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核酸的純化,濃縮和定量了解下
閱讀次數:630 發布時間:2021/3/12 10:37:35
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、核酸的純化

在分子克隆的所有操作中,zui基本的操作是核酸的純化。其關鍵步驟是去蛋白質,通常只要用酚/氯仿。氯仿抽提核酸的溶液即可。每當需要把克隆有某些所用的酶滅活或去除以便進行下步時,可進行這種抽提。然而,如要從細胞裂解液等復雜的分子混合物中純化核酸,則要先用某些蛋白水解酶消化大部分蛋白質后,再用有機溶劑抽提。這些廣譜的蛋白酶包括鏈霉蛋白酶及蛋白酶K等,它們對多種天然蛋白均有活性,(1)用酚氯仿抽提:這兩種有機溶劑合用,比單獨用酚抽提的除蛋白效果更佳。繼而用氯仿抽提則可除去核酸制品中的痕量酚。①核酸樣品置有蓋小離心管中,加入等體積的酚/氯仿。②旋渦混勻管內容物,使呈乳狀。③12000×g室溫離心15。④水相移入另離心管,棄去兩相界面和有機相。⑤重復步驟①-④步操作,直至兩相界面上見不到蛋白質為止⑦按下述核酸濃縮法沉淀回收核酸。

二、核酸的濃縮

應用zui廣的核酸濃縮法是乙醇沉淀法。在中等濃度單價陽離子存在下,加入定量的乙醇后,所形成有核酸沉淀可經離心而回收,甚至對低至pg量的DNA或RNA,也可定量回收。回收的核酸可按所需濃度,再溶于適當的緩沖液中。
具體操作時,可向含樣品的小離心管中加入V/10單價陽離子鹽貯存液2V無水乙醇,混勻,放冰水浴中15-30min,取出目測平衡,0-4度,12000g,離心10min。吸棄上清,再另70%乙醇0.5-1ml,12000g,0-4度洗滌離心2min。吸棄上清,沉淀用油泵抽干或打開蓋子晾干后,溶于適當體積的緩沖液中。

單價陽離子鹽的選擇,主要基于下述考慮:用醋酸銨可減少dNTP的共沉淀,但在以后要作核酸的磷酸化時應避免用醋酸銨,因銨離子是T,多核苷酸激酶的強烈抑制劑。當用較高濃度的乙醇沉淀RNA時,常用LiCl,因LiCl在乙醇中溶解度很高,不隨核酸共沉淀。含有SDS的核酸樣品,應使用NaCl,這時該去垢劑要70%乙醇中仍保持可溶。DNA和RNA沉淀,大多使用醋酸鈉(pH5.2 )。

三、DNA、RNA的定量

準確的方法是紫外分光光度法。但本法要求核酸樣品是純凈的(即無顯著的蛋白質、酚、瓊脂糖或其它核酸、核苷酸等污染物的制品)。用紫外分光光度計測定260nm和280nm兩個波長處的光吸收,然后,按IA260相當于50μg/ml雙鏈DNA。40μg/ml單鏈DNA或RNA及20μg/ml單鏈寡核苷酸。計算你的樣品含量。260nm和280nm兩處讀數的比值(A260/A280),可反映核酸的純度。DNA和RNA純品的A260/A280的值分別為1.8和2.0如果樣品中有蛋白質或酚的污染,則A260/A280將明顯低于此值,此時就無法對樣品中的核酸進行精確定量。可將樣品純化后再作定量測定。有豐富實驗室經驗的人,僅憑樣品電泳后溴化乙錠染色螢光帶的強度,即可大致判斷出樣品中的核酸含量,故他們常不作核酸的紫外分光光度法定量。
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