內參
抗體可用于評價
蛋白質免疫印跡法(Western Blot)的效率,比較凝膠中每孔的蛋白上樣量。此類對照可幫助確定樣品間表達水平的差異,以判斷是由
細胞裂解物的實際蛋白水平導致,還是由上樣量的差異導致。
內參抗體在目標蛋白的免疫熒光研究中,也可以作為共染的陽性對照。內參抗體分為未標記型和標記型,標記物包括生物素、HRP、FITC、PE、Cy染料和Alexa Fluor染料。
內參抗體種類很多,比如β-actin、β-tubunlin、GAPDH、Vinculin、Lamin B、PCNA等,其選擇常使我們困惑。本文將簡單介紹選擇內參抗體應遵循的五項原則:
一、樣本種屬來源:
首先要考慮實驗樣本來源于什么物種。
1. 哺乳動物的組織或者細胞樣本,通常選擇β-actin、β-tubulin、GAPDH、Lamin B、Histone H3、Na,Katpase等。
2. 植物來源實驗樣本,則可以選擇plant actin、Rubisco等。
3. 其他來源樣本研究較少,所以就應該參照文獻報導,選擇合適的蛋白作為內參。
二、分子量大小:
選擇內參抗體時,應該考慮目的蛋白分子量的大小,一般保證目的蛋白與內參蛋白分子量相差5KD以上。例如,目的蛋白分子量為40KD,此時不適宜選擇β-actin、與GAPDH作為內參,可以考慮選擇α-Tubulin或者β-tubulin作為內參。
三、表達水平:
選擇的內參蛋白需要在待測樣本中是高表達的。常用的內參蛋白是由管家基因高表達的,是細胞發育和維持細胞活力所必須的。例如,細胞核的內參蛋白 PCNA,在 DNA S 期表達,因此對于非增殖細胞不推薦使用。
四、表達因素:
選擇蛋白表達不受實驗變量影響的內參。
●在做多組織多細胞樣本對比表達量時,zui好選用 GAPDH作為內參,因為GAPDH是代謝類蛋白,在活組織中表達比較恒定。而β-Actin和β-Tubulin是結構蛋白,不同組織的細胞結構會有差異性;
●而在某些細胞中,由于組織缺氧、糖尿病等因素會導致GAPDH的表達增高,不適合做內參;
●涉及細胞增殖的相關試驗中,c-Jun由于自身表達變化不適合做內參;
●凋亡實驗時,TBP、Lamin等也不適合作為內參;
●做誘導后樣本或檢測磷酸化等修飾性抗體時,應選擇結構蛋白作為內參,如β-Actin 和β-Tubulin;
●做各種分泌液樣本的時候,如血漿、乳汁、組織液等,由于沒有完整的細胞結構,只能選擇一些分泌蛋白作為內參。