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技術文獻

確認過眼神,是要提質粒的人
閱讀次數:771 發布時間:2019/3/4 9:22:50
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相信大家作為實驗小白,剛進實驗室時,學的個實驗就是提質粒

想當年我們作為化學轉生物的研究生剛進實驗室時,覺得好酷炫的技術,跟在師兄后面,認真的對每一步的步驟都做好筆記,后來才發現你自己不過是做了一份手寫版的說明書。

接下來的 N 年里,就是轉化,涂板,挑單克隆,搖菌,提質粒,酶切,連接,好想能夠有一個提質粒機器人,實現自動化生產。當我們習慣了省時省力,或許我們都已經連提取的原理都已經忘了。

那么如何避免成為一個機器人呢,我想不僅僅是要提的出質粒,還要在出現問題時知道如何找到原因并解決,這樣你就可以被稱為人工智能,簡稱 AI。

質粒是攜帶外源基因進入細菌中擴增或者表達的重要媒介,常用的方法有煮沸裂解法,堿提法等。而我們常用的 kit 是采用堿提法。


不同品牌的試劑盒具體操作步驟可能不同,但這個萬變不離其宗,基礎知識點還是不變的。

菌體在強堿性條件下裂解,釋放出包括質粒在內的核酸,蛋白等物質。

當 pH 恢復中性時,共價閉合環狀質粒 DNA 復性快,而線性的染色體 DNA 復性緩慢,細菌蛋白質、破裂的細胞壁和變性的染色體 DNA 會相互纏繞成大型復合物,而后者被十二烷基硫酸鹽包蓋。

當用鉀離子取代鈉離子時,復合物會從溶液中有效地沉淀下來,離心除去變性劑后,就可以從上清中回收復性的質粒 DNA。

未提出質粒或者得率較低?

1、菌。用錯板子導致菌沒有長起(抗生素的種類和濃度)

搖過夜一不小心第二天忘記了此時多半菌液老化

2、堿裂解不充分。高速離心收菌倒掉上清后,能彈彈彈(彈不走魚尾紋)

3、溶液使用不當。看清哪些溶液應加熱到一定的溫度才能使用;哪些又是應該 加入醇之后使用

4、拷貝數較低或者菌體中無質粒。低拷貝數載體常常導致質粒 DNA 提取量過低;質粒在某些菌體中經過多次轉接可能出現丟失;

基因組 DNA 或蛋白質污染!

1、加溶液 2 后不要劇烈搖晃,溶液 2 處理時間不能太久,一般顛倒 6-8 次即加溶液 3 中和,堿裂解時間過長容易產生基因組污染;

2、加溶液 3 后要混合充分,離心后取上清小心不要吸到白色沉淀;

3、不要使用過多菌體。溶液 P1、P2、P3 處理并離心后溶液應為澄清的,如果還混有微小蛋白懸浮物,可再次離心。

不過我們也不能死搬硬套,也要學會融會貫通,舉一反三,當出現超出大綱范圍的題目如出現 15kb 的大型質粒,這時要注意采用溫和的方法(溶菌酶法),因為劇烈的方法容易使它受到破壞。

俗話說的好,每日一提,強身健體。不過小提怡情,大提還需謹慎啊,當聽說曾經發生過由于沒有配平而出現離心機直接旋出甚至將天花板損壞的壯觀場景,你們能想象我如今坐在高速離心機旁邊的心情嗎,(幸好我買了保險)。

原創作者:上海遠慕生物科技有限公司

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